En la Facultad de Odontología de la Universidad de la República se dicta la asignatura de Microbiología que comprende el estudio de los conceptos básicos sobre Microbiología General y Bucodental, destacando las características morfológicas y fisiológicas de Bacterias, Virus, Hongos, Protozoarios y otros agentes infecciosos. En cada grupo de microorganismos se ha incluido la patogénesis de los procesos infecciosos producidos por ellos, así como también su diagnóstico. Además se se le ha dado mayor énfasis a los microorganismos que comúnmente se relacionan con las infecciones de la cavidad bucal y a las diferentes maneras de cómo prevenir la transmisión de estas, estudiando los principios de bioseguridad y los agentes físicos y químicos a utilizar. Incluye también el estudio microbiológico de enfermedades prevalentes de la cavidad oral, como la caries dental y la enfermedad periodontal y como realizar el diagnóstico microbiológico de las mismas.

 Las unidades temáticas de Microbiología se dictan en 2do año de la carrera de pregrado de la carrera de Odontología, con el nombre de Patología 1 y en 3er año de la carrera de pregrado de la carrera de Odontología, con el nombre de Patología 4B.